保持板式换热器板片的清洁是保持高传热系数的重要条件之一。在板片间，介质是沿着狭窄曲折的流道运动的，即使产生不太厚的垢层，也将引起流道的变化，从而影响流体的运动，使压降增加，传热系数下降，严重的话将会让流道堵塞，不能继续运行。
1、 化学清洗法
这种方法是将一种化学溶液循环地通过板式换热器，使板片表面的污垢溶解、排出。此法不需要拆开换热器，简化了清洗过程，也减少了清洗的劳动程度。由于板片波纹能加快清洗液剧烈湍流，利于垢层溶解，所以化学清洗法是比较好的一种清洗方法。
2、机械（物理）清洗法
这种方法是将板片后用刷子进行人工洗刷，从而完成清理板片表面污垢的目的。此法虽然比较直接，但对较坚硬、较厚的垢层，清洗干净比较困难。
3、 综合清洗法
对于污垢层比较坚硬又较厚的情况，单纯采用上述一种方法都很难清洗干净。综合法是先用化学清洗法软化垢层，再用机械（物理）清洗法除去垢层，以保持板片清洁干净。